Numerazione fatture elettroniche di vendita

Abbiamo in contabilità ditte che hanno più punti vendita. Queste hanno adottato una numerazione distinta per ogni punto vendita facendole seguire da una barra "/" e da numero che identifica lo specifico punto vendita ( esempio n. 01/01 , 01/02, 01/03-02/01,02/2-03/01,03/02 ecc). Purtroppo il loro sistema, quando le fatture vengono emesse contemporaneamente da più punti vendita, sembra che a volte non gestisca bene le numerazioni e gli invii. Ad esempio ci siamo accorti, imputandole in contabilità che per alune fatture è stato "occupato" un numero esempio 03/02 ma la fattura non è mai stata spedita, mentre la stessa fattura risulta essere stata compilata con il n. 04/02 e spedita regolarmente.

In altri casi il numero era semplicemente stato saltato . Di fatto c'è un "buco" di numerazione nelle fatture emesse.

Poichè queste fatture non sono mai state inviate (al pari di una fattura scartata) , pensavamo di far emettere una nota di accredito solo interna a storno totale delle fatture non spedite indicando la motivazione ed eventualemnte che la fattura era sta correttamente inviata con il n. XX/YY.

Questo modo di operare è corretto ?? 

O si deve fare in altro modo ??

Grazie